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PHYSBOを使った実験・計算のためのベイズ最適化pythonプログラム

GUI (Graphical User Interface) 版

公開対象: D²MatE拠点、神谷・片瀬研究室

プログラム: bayes_gp_gui.py (GUI)

必要ファイル:
・ CLI版 bayes_gp_plain.py (ソースコード・実行結果)
     　　　詳細: PHYSBOを使った実験・計算のためのベイズ最適化pythonプログラム
・ tklib

推奨動作環境: インストールの仕方は本ページ最後をご覧ください

• pythonバージョン 3.6以上
• Anaconda / python3
  　他のpython環境でも、必要なモジュールをインストールすれば動くと思います。
• PHYSBO

【注意】 Windows版の最新のAnaconda3/python3.9では、PHYSBOのインストールに Visual C Tookitが必要です。
さらに、numpyでエラーが起こります。
その場合、python3.6環境を作って実行してください

使用方法

1. 準備:
   ・ 拠点・研究室の共有フォルダーから以下をダウンロードして、適当なディレクトリィに展開します。
   　適当なドライブのルートに \tkProg をつくり、その下に tklib、tkprog_MDX あるいはtkprog_COE をコピーすることをお勧めします。
   　tkProgのディレクトリィを [tkProg]、tkprog_MDX/tkprog_COE を [tkprog_XXX] と書きます。
   　　tkProg\tklib
   　  tkProg\tkprog_MDX¥PHYSBO (拠点メンバーの場合)
   　  tkProg\tkprog_COE¥PHYSBO (研究室メンバーの場合)
   ・ 環境変数 PYTHONPATH に [tkProg]\tklib\python を追加する。
   　
2. 実行環境:
   　python3.6環境が必要な場合、環境を変更してください。
   　　例: conda activate py36
   　
3. カレントディレクトリィを 「tkprog_XXX]¥PHYSBO に変更します。
   [tkprog_XXX] が D: ドライブにある場合の例。
   　> d:
   　> cd [tkprog_XXX]
    
4. bayes_gp_gui.py を実行します。
   　> python bayes_gp_gui.py
   
    
5. Input: の openボタンをクリックし、入力ファイルを選択します。
   
   　
6. analyzeボタンを押して解析を実行します。
   
   　
7. 次の候補の記述子、予測平均／標準偏差をみるには、グラフ中のデータ点近傍をクリックします。最近接データの情報がコンソールに表示されます。
   
   
8. 上記のグラフのデータは、Output: ファイルに保存されています。
   Output: の "app" ボタンで auto あるいは start を選ぶと、Excelで表示されます (Windowsのみの機能かもしれない)。
   　
9. その他の機能、オプションについては PHYSBOを使った実験・計算のためのベイズ最適化pythonプログラム をご覧ください。

インストール方法

• Anacondaのインストール方法: Install-Anaconda3.pptx
• Visual Code Studioのインストール方法 (使う人のみ): Install-Editor-VSCode.pptx　
  Install-Editor-VSCode-E.pptx
• Windows 8/10の環境変数の設定方法: Install-EnvironmentVariables-Windows.pptx

1. Anacondaの仮想環境作成
   　python3.6の環境を作成します
   　> conda create -n py36 python=3.6
   　
2. py36 を有効化します
     > conda activate py36
   　
3. pysboをインストールします
     > pip install physbo
   　
4. matplotlibをインストールします
     > conda install matplotlib
   　
5. pandasをインストールします
     > conda install pandas
   　
6. openpyxlをインストールします
     > conda install openpyxl
    

tklib / bayes_gp_gui.py を使う場合

1. chardetをインストールします
     > conda install chardet
    
2. tkinterをインストールします
    > conda install tkinter

tclライブラリィが見つからないというエラーが出た場合、環境変数に
TCL_LIBRARY=C:\Pythonインストール先\tcl\tcl8.6
を設定してください

tklibのインストール

1. 拠点・研究室の共有フォルダーから以下をダウンロードして、適当なディレクトリィに展開します。
   適当なドライブのルートに \tkProg をつくり、その下に tklib、tkprog_MDX あるいはtkprog_COE をコピーすることをお勧めします。
   tkProgのディレクトリィを [tkProg]、tkprog_MDX/tkprog_COE を [tkprog_XXX] と書きます。
   　tkProg\tklib
   　tkProg\tkprog_MDX¥PHYSBO (拠点メンバーの場合)
   　tkProg\tkprog_COE¥PHYSBO (研究室メンバーの場合)
   　
2. 環境変数 PYTHONPATH に [tkProg]\tklib\python を追加する。